使用 CHARMM-GUI 与 GROMACS 构建蛋白-小分子水溶液体系

从头开始离线编译最新版LAMMPS

本文详细介绍了 CP2K 软件的入门知识，包括输入文件的结构、常用模块（如 GLOBAL、FORCE_EVAL、MOTION）的设置方法，以及能量计算、几何优化、晶胞优化、分子动力学模拟和过渡态搜索等常见计算任务的具体操作。同时，还涉及了单位转换、SCF 收敛算法选择、输出结果分析等关键要点。

在新宫的温馨小家，可乐和乐意度过了它们的第一个生日。